Masiaksaurus mesurait 1,80 mètre de long, 60 centimètres de haut et pesait 35 kilogrammes. Sa principale caractéristique sont ses longues dents courbées vers le devant. On suppose que sa mâchoire incurvée vers le bas lui permettait de saisir de petites proies (insectes, lézards et peut-être même fruits, ou de capturer des poissons avec sa mâchoire antérieure et de les déchiqueter avec ses dents du fond). Masiakasaurus, contrairement aux autres Noasauridae, possède un crâne long et bas. Son trait le plus marquant est probablement sa mâchoire incurvée vers le bas, à un angle d'environ